ProLIF 文献资料 讲解 CI 聚酰亚胺 执照 描述 ProLIF（蛋白质-配体相互作用指纹图谱）是一种工具，用于生成用于从分子动力学轨迹和对接模拟中提取的蛋白质-配体和蛋白质-蛋白质相互作用的相互作用指纹。 它还支持DNA配体，DNA蛋白质和DNA-DNA相互作用。 您可以在上进行任何安装之前尝试一下。 文献资料 可在在线找到安装说明，文档和教程。 问题 如果发现错误，请在页面上打开一个问题。 讨论 如果您对如何使用ProLIF有疑问，或者想提供反馈或分享想法和新功能，请前往页面。 引用ProLIF 请参考文档上的。 执照 除非另有说明，否则此目录和所有子目录中的所有文件均根据Apache License 2.0版分发 Copyright 2017-2021 Cédric BOUYSSET Licensed under the Apache License, Versi

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林德曼 lindemann是一个Python软件包，用于计算LAMMPS轨迹的Lindemann指数以及每帧温度斜坡的Lindemann指数的变化，以进行相变分析。 安装 它需要python 3.7 pip install lindemann 或与Poetry安装 poetry add lindemann 用法 lindemann [OPTIONS] TRJFILE 或与Poetry安装： poetry run [OPTIONS] TRJFILE 注意事项： 尽管有-t标志，但在运行任何标志之前，请确保您有足够的可用内存。您可以使用-m或--mem_use选项检查内存使用情况。带有轴的numpy.nanmean（）函数可用于numba时，将修复高内存使用情况。 多重处理： 如果您没有可用于分配工作负载的hpc环境，则在使用本地计算机的情况下，我添加了多处理来并行化任务。只需使用-

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