### Discovery Studio在抗体领域的应用 #### 一、抗体设计与改造的重要性 抗体作为一种重要的生物分子，在生物学和医学领域中有着广泛的应用。它们以其高度特异性和较低的毒副作用，在疾病的诊断、治疗及科学研究中扮演着不可或缺的角色。针对特定的靶标如肿瘤特异性抗原、细胞因子受体等，通过传统的免疫方法或是现代的细胞工程和基因工程技术制备出的多克隆抗体、单克隆抗体、基因工程抗体等，不仅提高了医疗水平，还促进了相关产业的发展。 #### 二、Discovery Studio的功能模块 **1. 抗体结构构建及人源化改造** - **同源建模**: Discovery Studio提供了全面的抗体同源建模工具，用户只需输入抗体的氨基酸序列，即可完成抗体可变区、全长、CDR Loop注释、建模、模型优化及模型结构可信度评估等工作。 - **人源化改造**: 通过对非人源单克隆抗体的表面进行人源性氨基酸残基替换，以降低其免疫原性，同时保持抗体整体的空间结构不变。这对于提高抗体药物的安全性和有效性至关重要。 **2. 抗原表位确定** - **蛋白-蛋白对接**: Discovery Studio中的蛋白-蛋白对接程序基于经典的ZDOCK/RDOCK开发而成，利用快速的傅立叶变换技术，根据抗原、抗体之间的形状匹配搜索结合构象，获得参与抗体-抗原相互作用的氨基酸和相互作用强度等详细信息。 - **表位预测**: 通过计算机预测方法确定抗原表位，这在实验技术条件有限的情况下尤为重要。预测抗原表位不仅可以提高实验效率，还可以帮助研究人员更好地理解抗体与抗原的相互作用机制。 **3. 抗体设计与改造** - **虚拟氨基酸突变**: Discovery Studio支持对抗体进行虚拟的丙氨酸扫描和饱和突变，甚至其他任意类型的突变，能够在考虑温度、pH等因素下预测抗体的热稳定性和抗体-抗原结合力的变化，为实验中的定点突变提供指导。 - **聚集效应预测**: Discovery Studio能够预测抗体表面氨基酸的聚集倾向，通过这种预测可以找到可能导致聚集的位点，并通过定点突变来提高抗体的稳定性。 #### 三、案例分析 **1. 利用同源建模和相互作用能计算研究抗体专一性** - **案例背景**: 作者利用DS_MODELER对合征布尼亚病毒SFVS virus的抗原蛋白进行同源建模，并利用DS_CDOCKER与抗体小分子对接，发现三个可能的抗原表位区域。通过定点突变的方法验证了这些表位的准确性。 - **实验结果**: 实验结果显示，经过定点突变验证的抗原表位与模型预测结果基本一致，证明了Discovery Studio在抗体专一性研究中的有效性。 **2. 利用分子模拟技术辅助鼠源抗体的人源化改造** - **案例背景**: 本案例中，研究者应用分子模拟技术辅助抗体表面重塑，目标是对鼠源单克隆抗体m357进行人源化改造。m357能够与人体肿瘤坏死因子作用，具有潜在的抗肿瘤效果。 - **技术路径**: 使用DS_MODELER构建m357可变区的三维结构；接着，利用分子模拟技术进行表面重塑，即替换非人源的氨基酸残基为人源性残基，以降低其免疫原性。 - **实验意义**: 通过这种方法改造的抗体能够显著降低人体对鼠源抗体的免疫排斥反应，提高其安全性和有效性，为临床应用提供了有力的支持。 Discovery Studio在抗体设计、改造及研究方面提供了强大的工具和支持，极大地促进了抗体领域的科研进展和技术革新。

肾母细胞瘤（Wilms tumor，WT，又称肾母细胞瘤或肾母细胞癌），是一种主要发生在儿童的肾脏恶性肿瘤，成人中极为罕见。肾母细胞瘤的早期诊断对于治疗和预后具有极其重要的意义。本文通过蛋白质组学技术，旨在发现并鉴定肾母细胞瘤的特异性血清蛋白质标志物，从而为肾母细胞瘤的无创、便捷的血清学诊断提供潜在的生物标志物。 研究中利用裸鼠构建了肾母细胞瘤模型，通过注射肾母细胞瘤细胞到鼠的双侧腹部。收集了94个血清样本进行分析，其中包含45个肾母细胞瘤样本和49个对照样本。使用SELDI-TOF-MS技术分析血清蛋白质谱，通过HPLC纯化候选生物标志物，并利用LC-MS/MS技术进行鉴定。为了验证，采用Protein Chip免疫测定法对结果进行验证。研究最终筛选出两个差异蛋白（m/z 4509.2和6207.9），分别鉴定为载脂蛋白A-II和多泛素。在肾母细胞瘤组中，载脂蛋白A-II的表达高于对照组（P<0.01），而多泛素的表达则低于对照组。研究结论认为，载脂蛋白A-II和多泛素可能作为儿童肾母细胞瘤的潜在生物标志物，其分析有助于肾母细胞瘤的诊断和治疗。 蛋白质组学（proteomics）是研究一个细胞、组织或整个有机体的蛋白质组的科学，包括蛋白质的表达、翻译后修饰、定位、相互作用等。蛋白质组学技术能够提供大量的蛋白质信息，从而为疾病的生物标志物发现和病理机制研究提供有力工具。 表面增强激光解吸/电离飞行时间质谱（SELDI-TOF-MS）是用于蛋白质组分析的常用技术之一，其优势在于能够对复杂的生物样本进行快速分析并筛选出差异表达的蛋白质。 高效液相色谱（HPLC）是一种液相色谱分析方法，主要用于分离、鉴定和定量混合物中的各种成分，包括蛋白质和肽等。 液相色谱-串联质谱（LC-MS/MS）结合了液相色谱的分离能力和质谱的鉴定能力，是鉴定蛋白质和多肽结构的强有力的工具。 Protein Chip技术结合了固相色谱和质谱的优点，能够对血液、细胞等复杂生物样品中的微量蛋白质进行捕获、分离、鉴定和定量，是蛋白质组学研究中的重要技术手段。 本研究中的关键词包括手术（surgery）、蛋白质组学（proteomics）、肾母细胞瘤（Wilms tumor）和生物标志物（biomarker），这些关键词描述了研究的主要内容和方向。 肾母细胞瘤是儿童中最常见的泌尿生殖道实体瘤，发病率为活产婴儿的十万分之一。肾母细胞瘤的早期诊断和及时治疗对于提高患者的生存率和预后有着决定性的作用。通过蛋白质组学技术筛选出的生物标志物具有无创、便捷、准确等优点，对提高肾母细胞瘤的临床诊断水平和患者的生存质量具有重要意义。 本研究通过蛋白质组学技术筛选和鉴定出了肾母细胞瘤特异性的血清蛋白质标志物，为未来的肾母细胞瘤血清学诊断和预后监测提供了新的思路和方法。

紫精导向的卤化铜杂化分子的可逆电双稳行为：实验和理论研究，李浩宏，李奕，本文报道了一个紫精导向的卤化铜杂化分子 [(EV)(Cu2I4oI2)]n (1) 的结构及其电双稳行为。其结构基于紫精阳离子模板导向剂[depp]2+导向下的[C

ubnt-discovery-v2.3 发现工具

AP Discovery Tool，摩托罗拉无线AP配置工具软件。压缩包里有详细的说明文档。

STM32F429_Discovery_UCOSII_移植

qmdnsengine：用于Qt应用程序的多播DNS库

############################################### #### #STM32F100 VL 探索板-ST7735 LCD 库################################## ################## ＃＃要求：＃＃ STM32F100 价值线探索板 1.8" TFT LCD 模块 (ST7735R) ARM GCC 工具链安装arm-none-eabi GDB服务器 此存储库中包含的库 ＃＃安装：＃＃ 克隆或下载此存储库的本地副本 ST7735LCD目录内是 LCD 库的源代码。 spi.c spi.h是用于与 LCD 通信的 SPI 函数的来源 ST7735.c ST7735.h是各种 ST7735 LCD 功能的源代码 main.c main 函数所在的位置 将源码编译成ST7735.elf 使用

STM32F4-Discovery_FW_V1.1.0，包含一系列的外设例程。里面有IAR工程和KEIL工程。想学习STM32F4XX的可以参考。

discovery工程、gsoap源码包，博客中有详细图文教程。