和声2
公用事业
使用
TCR
测序数据收集肿瘤浸润淋巴细胞单细胞实验
介绍
使用配对
TCR
测序组装公开可用的肿瘤浸润性
T
细胞
(TIL)
数据集的初衷是扩展和改进
R
包。
但是,经过一番讨论,我们决定为大家发布数据集,测序运行的完整摘要和样本信息可以在Seurat对象的元数据中找到。
该存储库包含用于数据集的初始处理和注释的代码(我们将此版本称为
0.0.1)。
这涉及几个步骤:1)加载相应的
GE
数据,2)通过样本和队列信息协调数据,3)通过自动注释进行迭代,4)通过手动检查和富集分析统一注释,以及
5)添加
TCR
信息。
此信息存储在
Seurat
对象的元数据中
-
每个变量的解释都可用。
队列信息
这是当前的数据源列表,通过组织类型过滤的细胞数量。
如果您使用实用程序,请引用数据!
血液
尤斯塔
LN
普通的
瘤
癌症类型
添加日期
引文
CCR-20-4394
0
0
0
0
26760
卵巢
21
年
6
月
19
日
GSE114724
0
0
0
0
27651
胸部
21
年
6
月
19
日
GSE121636
12319
0
0
0
11436
肾
2025-09-05 15:20:36
1.67GB
系统开源
1