内容概要:本文展示了带有CBAM注意力机制改进的U-Net架构模型的具体实现,使用PyTorch作为深度学习库。文中定义了ChannelAttention(信道注意力)和SpatialAttention(空间注意力)这两个重要子模块来提高模型对特征的理解力。接下来,还描述了网络不同层次之间的下采样、跳跃连接以及最后输出部分所使用的特定操作细节。最后,给出了模型实例化及简单调用的方法,并测试了随机生成的数据样本输出维度验证模型搭建正确无误。 适合人群:本教程主要适用于有一定机器学习或深度学习基础,并初步掌握PyTorch环境配置的相关开发者和技术爱好者,同时也非常适合从事医学影像分析或其他图像处理相关科研工作的专业研究人员用来进行项目实践探索。 使用场景及目标:这个模型可以应用于各种需要精确识别对象轮廓的任务如细胞计数检测、皮肤病灶边界分割等方面;其核心目的就是利用深度卷积神经网络提取图像特征,并借助注意力机制提升特征表达质量从而改善最终预测精度。 其他说明:此项目不仅限于二分类任务,只要调整相应的类别数即能应对多类别的情况,此外还允许用户选择不同的采样方式以适应更多种分辨率的图片处理需求。
2025-04-15 09:44:41 7KB 深度学习 PyTorch 图像分割 U-Net
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该资源包含基于U-Net模型的医学图像分割任务完整代码及不同注意力机制(如SENet、Spatial Attention、CBAM)下的训练结果。资源实现了数据预处理、模型定义、训练与验证循环,以及结果评估与可视化,提供了详细的实验记录与性能对比(如Accuracy、Dice系数、IoU等关键指标)。代码结构清晰,易于复现和扩展,适用于医学图像分割研究和U-Net模型改进的开发者与研究者参考。 在人工智能领域,图像分割技术一直是一个备受关注的研究方向,特别是在医学图像分析中,精确的图像分割对于疾病的诊断和治疗具有重要的意义。ISIC(International Skin Imaging Collaboration)项目提供了大量的皮肤病医学图像,这对于研究和开发图像分割模型提供了宝贵的资源。UNet作为卷积神经网络(CNN)的一种变体,在医学图像分割领域表现出了优异的性能,尤其是它的结构特别适合小样本学习,并且能够捕捉图像的上下文信息。 本研究利用UNet模型对ISIC提供的皮肤病医学图像进行了分割,并在此基础上加入了注意力机制,包括SENet(Squeeze-and-Excitation Networks)、CBAM(Convolutional Block Attention Module)等,以进一步提升模型性能。注意力机制在深度学习中的作用是模拟人类视觉注意力,通过赋予网络模型关注图像中重要特征的能力,从而提高任务的准确性。SENet通过调整各个特征通道的重要性来增强网络的表现力,而CBAM则更加细致地关注到特征的二维空间分布,为网络提供了更加丰富和准确的注意力。 研究结果表明,在引入了这些注意力机制后,模型的分割准确率达到了96%,这显著高于没有使用注意力机制的原始UNet模型。这样的成果对于医学图像的精确分割具有重要的意义,能够帮助医生更准确地识别和分析病灶区域,从而为疾病的诊断和治疗提供科学依据。 本资源提供了一套完整的医学图像分割任务代码,涵盖了数据预处理、模型定义、训练与验证循环、结果评估和可视化等关键步骤。代码结构设计清晰,方便开发者复现和对模型进行扩展,不仅对医学图像分割的研究人员有帮助,同时也对那些想要深入学习图像分割的AI爱好者和学生有着极大的教育价值。 通过对比不同注意力机制下的训练结果,研究者可以更深入地理解各种注意力机制对模型性能的具体影响。实验记录详细记录了各个模型的关键性能指标,如准确率(Accuracy)、Dice系数、交并比(IoU)等,这些都是评估分割模型性能的常用指标。通过这些指标,研究者不仅能够评估模型对图像分割任务的整体性能,还能够从不同维度了解模型在各个方面的表现,从而为进一步的模型优化提供指导。 这份资源对于那些希望通过实践来学习和深入理解医学图像分割以及U-Net模型改进的研究人员和开发人员来说,是一份宝贵的资料。它不仅包含了实现高精度医学图像分割模型的代码,还提供了如何通过引入先进的注意力机制来提升模型性能的实践经验。
2025-04-06 19:24:08 440.34MB UNet 注意力机制
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细胞分割是生物医学图像分析中的一个关键任务,它涉及到在显微镜图像中精确地识别和区分单个细胞。UNet是一种在该领域广泛应用的深度学习模型,由Ronneberger等人于2015年提出。这个模型尤其适用于像素级别的分类问题,如细胞分割、语义分割等。在本文中,我们将深入探讨UNet模型的结构、工作原理以及如何使用PyTorch实现。 **UNet模型结构** UNet模型的核心设计理念是快速的信息传递和上下文信息的结合。它主要由两部分组成:编码器(Encoder)和解码器(Decoder)。编码器部分采用卷积神经网络(CNN)进行特征提取,类似于传统的图像分类网络,例如VGG或ResNet。解码器则负责恢复高分辨率的输出,通过上采样和跳跃连接(Skip Connections)将编码器的浅层特征与解码器的深层特征相结合,以保留更多的空间信息。 1. **编码器**:UNet的编码器通常由多个卷积层和池化层组成,每个阶段的输出特征图尺寸减小,特征维度增加,从而获取更高级别的抽象特征。 2. **跳跃连接**:在解码器阶段,每个解码层都与其对应的编码层通过跳跃连接进行融合,将低级别特征与高级别特征融合,增强分割的准确性。 3. **解码器**:解码器通过上采样操作恢复图像的原始分辨率,同时结合编码器的特征,最后通过一个或多个卷积层生成分割掩模。 **PyTorch实现** 在PyTorch中实现UNet模型,我们需要定义编码器、解码器以及跳跃连接的结构。以下是一般步骤: 1. **定义基础网络**:选择一个预训练的分类网络作为编码器,如ResNet18或VGG16,然后移除全连接层。 2. **构建解码器**:创建一系列的上采样层,每个层包含一个反卷积(Transpose Convolution)和两个卷积层,用于特征融合和输出映射。 3. **添加跳跃连接**:在解码器的每个上采样层之后,将编码器相应层的输出与之拼接,以利用低级特征。 4. **损失函数**:选择适当的损失函数,如Dice Loss或交叉熵损失,以适应像素级别的分割任务。 5. **优化器**:选择合适的优化器,如Adam或SGD,设置学习率和其他超参数。 6. **训练流程**:加载数据集,对模型进行训练,通常包括数据增强、批处理和epoch迭代。 7. **评估与测试**:在验证集和测试集上评估模型性能,如计算Dice系数、Jaccard相似度等指标。 **数据集准备** 在细胞分割任务中,数据集通常包含标注的细胞图像。每个图像与其对应的分割掩模一起,用于训练和评估模型。数据预处理可能包括归一化、缩放、裁剪等步骤,以适应模型的输入要求。此外,可以使用数据增强技术,如旋转、翻转、缩放等,以增加模型的泛化能力。 在提供的文件"u_net"中,可能包含了实现UNet模型的PyTorch代码、数据集处理脚本、配置文件以及训练和评估脚本。通过研究这些文件,我们可以深入了解如何将UNet应用于具体的数据集,并对其进行训练和优化。如果你想要自己动手实践,可以按照代码的指导逐步进行,调整模型参数,以适应不同的细胞分割任务。
2025-04-06 14:55:56 134.92MB 数据集
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**图像分割:Pytorch实现UNet++进行医学细胞分割** 图像分割是计算机视觉领域中的一个核心任务,它涉及将图像划分为多个具有不同语义意义的区域或对象。在医学成像中,图像分割尤其重要,因为它可以帮助医生识别和分析病灶、细胞结构等。PyTorch是一个流行的深度学习框架,其强大的灵活性和易用性使其成为实现复杂网络结构如UNet++的理想选择。 **UNet++简介** UNet++是一种改进的UNet架构,由Zhou等人于2018年提出,旨在解决UNet在处理重叠边界区域时的局限性。UNet++通过引入一系列密集的子网络连接,提高了特征融合的效率,从而在像素级别的预测上表现出更优的性能。这种设计特别适合对细胞、组织等微小结构的高精度分割。 **PyTorch实现** 在PyTorch中实现UNet++通常包括以下几个关键步骤: 1. **数据集处理**(dataset.py):你需要准备训练和验证数据集,这通常包括预处理图像和相应的标注图。`dataset.py`中会定义数据加载器,以批处理的方式提供图像和标签。 2. **模型结构**(archs.py):UNet++的结构由编码器(通常是预训练的卷积神经网络如ResNet)和解码器组成,它们之间通过跳跃连接和密集子网络连接。`archs.py`文件将定义UNet++的网络结构。 3. **训练过程**(train.py):在`train.py`中,你会设置训练参数,如学习率、优化器、损失函数(例如Dice损失或交叉熵损失)、训练迭代次数等,并实现训练循环。 4. **验证与评估**(val.py):验证脚本`val.py`用于在验证集上评估模型性能,通常会计算一些度量标准,如Dice系数或IoU(交并比),以衡量分割结果的质量。 5. **辅助函数**(losses.py, metrics.py, utils.py):这些文件包含损失函数实现、评估指标和一些通用工具函数,如保存模型、可视化结果等。 6. **命令行参数**(cmd.txt):`cmd.txt`可能包含运行训练或验证脚本时的命令行参数,比如指定设备(GPU/CPU)、数据路径等。 7. **开发环境配置**(.gitignore, .vscode):`.gitignore`文件定义了在版本控制中忽略的文件类型,`.vscode`可能是Visual Studio Code的配置文件,用于设置代码编辑器的偏好。 在实际应用中,你还需要考虑以下几点: - **数据增强**:为了增加模型的泛化能力,通常会在训练过程中使用数据增强技术,如旋转、翻转、缩放等。 - **模型优化**:根据任务需求调整网络结构,例如添加更多层、调整卷积核大小,或者采用不同的损失函数来优化性能。 - **模型部署**:训练完成后,将模型部署到实际应用中,可能需要将其转换为更轻量级的形式,如ONNX或TensorRT,以适应硬件限制。 通过理解并实现这个项目,你可以深入掌握基于PyTorch的深度学习图像分割技术,尤其是UNet++在医学细胞分割领域的应用。同时,这也会涉及到数据处理、模型构建、训练策略和性能评估等多个方面,对提升你的深度学习技能大有裨益。
2025-04-05 10:29:58 40.38MB pytorch unet 图像分割
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Swin-Unet是一种基于Swin Transformer的深度学习网络模型,主要应用于图像分割任务。Swin Transformer是Transformer架构在计算机视觉领域的一个创新应用,由Liu等人于2021年提出。它通过引入窗口内的自注意力机制,解决了传统Transformer全局自注意力计算复杂度高的问题,同时保持了对长程依赖的捕捉能力。 Swin Transformer的核心是层次化的结构,分为多个阶段,每个阶段由多个Swin Transformer块组成。这些块内部包含两个主要部分:窗口自注意力层(Window-based Multi-Head Self-Attention, W-MSA)和多层感知机(MLP)。W-MSA在每个窗口内进行自注意力计算,降低了计算复杂度,同时通过移窗策略连接相邻窗口,实现了跨窗口的信息交换。MLP则负责非线性变换,增强特征表达。 Swin-Unet是Swin Transformer与经典Unet结构的结合,继承了Unet的对称双路径设计,用于处理像素级预测任务,如语义分割。Unet的特点是其上下采样和上采样路径,能够有效地结合粗略的全局信息和精细的局部细节,从而在图像分割任务中表现出色。Swin-Unet将Swin Transformer模块集成到Unet的每个跳跃连接中,提高了模型的表示能力和分割精度。 预训练模型“swin-tiny-patch-window7-224.pth”是Swin-Unet网络在大规模数据集上训练得到的权重,其中"swin-tiny"表示这是一个轻量级的模型配置,适合资源有限的环境;"patch-window7"指的是模型使用了7x7的窗口大小进行注意力计算;"224"则代表输入图像的尺寸为224x224像素。这个预训练模型可以被用于初始化自己的Swin-Unet网络,然后在特定任务的微调上使用,以提高模型对新任务的适应性和性能。 在实际应用中,使用Swin-Unet进行图像分割时,首先需要加载这个预训练模型的权重,然后根据目标任务调整网络结构,例如改变输出通道的数量以匹配类别数。接着,用目标数据集进行微调,优化器通常选择Adam或SGD,学习率会采用余弦退火或步进衰减策略。在训练过程中,可以通过监控验证集的表现来调整超参数,以达到最佳性能。 Swin-Unet模型结合了Transformer的全局信息处理能力和Unet的高效特征融合,尤其适用于需要精确像素级预测的任务,如医疗影像分析、遥感图像处理等。而“swin-tiny-patch-window7-224.pth”预训练模型则为研究人员和开发者提供了一个强大的起点,帮助他们更快地在相关领域实现高性能的解决方案。
2025-04-03 21:06:18 100.11MB 机器学习
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每年有超过 400,000 例新发肾癌病例,手术是其最常见的治疗方法。由于肾脏和肾脏肿瘤形态的多样性,目前人们对肿瘤形态如何与手术结果相关 ,以及开发先进的手术计划技术 非常感兴趣。自动语义分割是这些工作的一个很有前途的工具,但形态异质性使其成为一个难题。 这一挑战的目标是加速可靠的肾脏和肾脏肿瘤语义分割方法的发展。我们已经为 300 名在我们机构接受部分或根治性肾切除术的独特肾癌患者的动脉期腹部 CT 扫描生成了真实语义分割。其中 210 个已发布用于模型训练和验证,其余 90 个将保​​留用于客观模型评估。
2025-04-01 19:37:00 33.12MB 计算机视觉 unet python 图像分割
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Unet 改进添加双交叉注意力模块(DCA),可以直接替换主干网络
2025-03-12 13:39:34 12KB
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标题中的"U-net脑肿瘤分割完整代码"是指一个基于U-Net网络的深度学习项目,用于脑肿瘤图像的自动分割。U-Net是由Ronneberger等人在2015年提出的一种卷积神经网络(CNN)架构,尤其适用于生物医学图像分析,因为它能够有效地处理小目标并且具有很好的定位能力。 描述中提到的"数据集"是这个项目的基础,通常包含多种类型的脑部MRI或CT扫描图像,每张图像都带有标注,指示肿瘤的位置和边界。这些数据用于训练和验证模型,确保其能准确地识别和分割肿瘤区域。 "网络"指的是U-Net网络结构,它由两个对称的部分组成:一个下采样路径和一个上采样路径。下采样路径用于捕获图像的全局上下文信息,而上采样路径则与下采样路径的特征图相结合,以实现精确的像素级分类,即肿瘤分割。 "训练"过程是将数据集输入到网络中,通过反向传播和优化算法(如Adam或SGD)调整网络权重,以最小化预测结果与实际标注之间的差异。"测试"是在模型训练完成后,使用未参与训练的数据评估模型性能,常用指标包括 Dice 相似系数、IoU(Intersection over Union)等。 "只跑了20个epoch"意味着模型在整个数据集上迭代了20次。通常,更多的epochs可以提升模型性能,但也要注意防止过拟合,即模型过度学习训练数据,导致对新数据的表现下降。 标签"软件/插件"可能表明此项目涉及到一些用于图像处理、数据预处理或模型训练的特定工具或库,例如Python的TensorFlow、Keras或者PyTorch框架,以及用于图像操作的OpenCV、Numpy等库。 在压缩包子文件的文件名称列表中,"Unet"可能是包含了该项目源代码、数据集、配置文件和其他相关资源的文件夹。用户可能需要解压并按照提供的指南运行代码,以便查看和复现实验结果。 总结来说,这个项目涉及了深度学习中的U-Net网络应用,特别是在脑肿瘤分割任务上的实践。通过训练和测试,模型学习从MRI或CT图像中识别肿瘤,并在新的图像上进行预测。开发者使用了特定的软件和工具来实现这一目标,并且提供了一个20个epoch的训练模型示例。对于想要深入理解U-Net网络或脑肿瘤分割技术的人来说,这是一个宝贵的资源。
2024-08-09 14:35:33 291.31MB
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概述 该代码适用于以下论文:用于视网膜血管分割的空间注意U-Net。 我们报告DRIVE和CHASE DB1数据集的最新性能。 布达佩斯技术经济大学(CME)的郭长禄(Changlu Guo)编写的代码。 我们在Ubuntu 16.04上进行培训和评估,它也适用于Windows和OS。 数据集 数据扩充: (1)随机轮换; (2)增加高斯噪声; (3)色彩抖动; 2. (4)水平,垂直和对角线翻转。 如果您不想进行上述扩充,只需从我的链接下载即可。 快速开始 训练 运行或 测验 运行或Eval_chase.py 环境环境 凯拉斯2.3.1 Tensorflow = = 1.14.0 关于凯拉斯 Keras是一个极简的,高度模块化的神经网络库,用Python编写,能够在TensorFlow或Theano上运行。 它的开发着重于实现快速实验。 能够以最小的延迟将想法付诸
2024-05-06 12:41:03 11.38MB Python
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UNet++模型本身并不是直接用于图片分类的,而是主要用于图像分割任务,特别是医学图像分割。UNet++是UNet模型的一个改进版本,通过引入深度监督和密集跳跃连接来增强特征提取和融合的能力,从而提高了分割精度。 然而,如果你希望使用类似UNet++的结构进行图片分类任务,你可以进行一些调整。一种可能的方法是将UNet++的解码器部分(即上采样和特征融合部分)替换为一个全局平均池化层和一个全连接层,以便输出分类结果。 以下是一个大致的步骤,描述如何将UNet++结构适应于图片分类任务: 编码器部分:保持UNet++的编码器部分不变,这部分主要用于从输入图像中提取特征。编码器通常由多个下采样块组成,每个块包含卷积层、归一化层和激活函数。 特征融合:在编码器部分,不同层次的特征图可以通过跳跃连接进行融合。这些融合的特征图有助于捕获不同尺度的信息。 替换解码器:在UNet++中,解码器部分负责将融合后的特征图上采样到与原始输入图像相同的尺寸。然而,在图片分类任务中,我们不需要这样的上采样过程。因此,你可以将解码器部分替换为一个全局平均池化层,用于将特征图转换为一个固定大小的特征向量
2024-04-16 20:27:24 400.09MB
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