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D.使用EAM势模拟Ni的剪切行为 v upper lower mobile z x y Ni FCC 晶格

分子动力学模拟的一些理论和实践

这个是lammps官网的第二个例子，里面有我个人的注释，几乎每行都有，能够快速学习，这个和第一个例子程序差不多，举一反三，第一个例子的程序差不多就会了。。

计算机辅助药物设计中的分子动力学模拟简介.pdf

采用结合双温方程的分子动力学方法，数值模拟脉宽为200 fs，能量密度为30~45 mJ/cm2 的超快激光与CuZr非晶合金的相互作用过程。模拟结果表明：超快激光作用下CuZr 非晶材料中原子加热速度比普通晶态金属慢得多；作用过程内部应力的演化表现为首先产生拉应力；并且随着温度与应力的演化，靶材内部产生空泡，空泡的平均大小和数目都与能量密度直接相关；靶材的烧蚀机制表现为机械破损，且烧蚀深度随着能量密度增大而增加。研究结果有助于更深入地理解飞秒激光与非晶合金相互作用机理。

单晶Cu纳米线单向拉伸和压缩的分子动力学模拟，袁林，张江伟，加工硬化现象普遍存在于金属塑性加工过程中。长久以来，这种现象一直吸引着人们的注意力。当在低温(T<0.3Tm)条件下施加应力时，加工

液晶相及缺陷的分子动力学模拟，游江坤，吴聪敏，本文进行了Gay-Berne液晶体系的分子动力学模拟,研究由于温度变化引起的液晶相变和由圆形边界限制导致的液晶缺陷。我们将液晶分子放�

matlab代码ab 什么是 AIMD_Toolkit AIMD_Toolkit 是一组用于处理 ab-initio 分子动力学轨迹的 Matlab 脚本。 当前功能 使用 AIMD_Toolkit，您可以 从 VASP 输出 XDATCAR 读取轨迹 使用 VESTA 可读的 CHG 格式创建核密度 引用 AIMD_Toolkit 如果您使用此代码，请引用以下论文 陆子恒等物理化学化学物理 17.48 (2015): 32547-32555。 卢子恒和弗朗西斯科·丘奇。 材料化学杂志 A 4.45（2016）：17740-17748。

这一款开源的优秀分子动力学模拟软件包，从事分子动力学研究的软件开发童鞋可以在此基础上进一步开发，或者将其作为科研工具也可以，采用编程语言为python和C。