基于高分子谷蛋白基因的中国节节麦系统关系,陈文杰,刘登才,通过对新疆及黄河流域节节麦的高分子谷蛋白基因序列的系统进化分析,探讨了我国节节麦的来源及传播关系。结果表明,在历史上至少
2024-03-22 12:53:52 1.23MB 首发论文
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ACE2基因多态性与糖尿病肾病的关系,王志达,赵希璐,目的:探讨ACE2基因多态性与糖尿病肾病的关系。方法 采用病例对照研究方法,以2012年4月至2013年9月间在天津医科大学代谢病医院住院�
2024-03-22 11:56:23 490KB 首发论文
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FOXP3基因多态性与原发性肝细胞癌的关系,陈衍辉,张恒辉,目的 探讨转录因子FOXP3基因单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphisms,SNPs)与原发性肝细胞癌(hepatocellular carcinoma,HCC)的关系。方法
2024-03-22 11:50:30 250KB 首发论文
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IL-13基因microRNA靶序列单核苷酸多态性与乳腺癌发病的关系,于洪媛,李京,目的 探讨IL-13基因microRNA靶序列结合区域的单核苷酸多态性及环境因素交互作用与乳腺癌发病的关系。方法 采用病例对照研究方法,首先
2024-03-22 11:47:59 389KB 首发论文
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乙醇代谢酶基因多态性对酒精性肝硬化的影响,周文婷,李景鹏,目的 研究乙醇代谢酶基因多态性与酒精性肝硬化(alcoholic liver cirrhosis, ALC)的关系,探讨遗传因素对其易感性的影响。 方法 应用PCR-RFLP�
2024-03-22 11:44:48 364KB 首发论文
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TLR4基因多态性与军团菌感染易感性的关系,王芳芳,王素萍,目的 了解山西人群肺部感染病人军团菌感染状况;初步探讨TLR4基因(2244G→A)及(2299A→G)多态性分布与军团菌感染的关系。方法 采用聚合�
2024-03-22 11:42:36 366KB 首发论文
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FABP2基因54位点多态性与结直肠癌易感性的关系,徐琳,冯斐,目的 探讨脂肪酸结合蛋白2(fatty acid binding protein,FABP2)基因54位点多态性以及该基因与环境因素的交互作用与结直肠癌易感性的关系。�
2024-03-22 11:35:36 311KB 首发论文
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matlab svr代码kaggle_表型 戴希扬@UMD CS 从基因型预测表型。 这是用于从基因型@UMD CMSC702 预测表型的 Kaggle 竞赛。 整个代码按原样提供。 要求 -Matlab -Libsvm/Libliner (for SVR) -DeepLearnToolbox (for NN regression) -vl_feat (for gmm) 建议的方法 团结 - logloss.m - dataloader.m - confusion_matrix.m - mynormalize.m - k_mer_feature.m - gmms_feature.m 特征选择 - feature_selection.m - fs_trian_test.m 降维 - dimension_reduct.m K-mer + 种群 + LASSO + NN/SVR - nfold_validation.m: Driver to run nfold cross validation on proporsed methods (SVR) - mytrain.m - mytest.m
2024-03-18 09:30:49 34.42MB 系统开源
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可视化基因组注释 D3 JavaScript基因组特征(gff)文件的交互式可视化 这引入了一个框架,用于创建(GFF)的交互式信息性可视化。 通用特征格式(GFF)也称为基因发现格式,是一种描述基因组和蛋白质序列特征的文件格式。 GFF文件是制表符分隔的文本文件,其中每个功能都在一行中描述。 有关GFF格式的更多信息,请访问 。 例如对于玉米,我使用的GFF文件看起来像- 9 ensembl chromosome 1 156750706 . . . ID=9;Name=chromosome:AGPv2:9:1:156750706:1 9 ensembl gene 66347 68582 . - . ID=GRMZM2G354611;Name=GRMZM2G354611;biotype=protein_coding 9 ensembl mRNA 66347 68582 . - .
2024-03-13 20:08:26 23KB Python
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金秋十月的深圳第十届中国高新技术成果交易会上,宝德科技因其生产的HPC高性能计算机揭开国宝大熊猫基因秘密倍受瞩目。宝德参与大熊猫基因研究的是POWER Cluster8000 HPC计算机系统,宝德POWER Cluster8000 HPC系统采用分层设计,按照高性能计算生态系统部署,自上而下,包括HPC并行应用程序、中间件集群管理、通信库以及各类软件优化工具、操作系统、计算节点和主控节点的硬件平台、互联网络系统等。方案具有开放性、可扩展、性价比高的特点,满足基因研究的应用需求。
2024-02-29 11:00:28 56KB
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