em算法matlab代码电磁场
HMRF的MATLAB实现，如“通过隐马尔可夫随机场模型和期望最大化算法对脑MR图像进行分段”（Zhang等人，2001年）所述。
HMRF被应用于从OASIS脑截面数据集中分割图像，但是提供的代码可以针对任何3D图像分割进行修改。
您可以在什么上测试此算法？
任何3D图像，但我已经使用OASIS截面数据集验证了模型。
该数据集由416名18-96岁的正常和早发的阿尔茨海默氏病患者组成。
数据集提供了地面真相标签-来自Zhang等人描述的HMRF的FAST-FSL实现。
纸。
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matlab分析成绩代码使用PHESANT的BMI的MR-pheWAS
该存储库随附本文：
Millard，LAC等。
使用孟德尔随机化方法（bioRxiv，2017）在30万以上个体中寻找BMI的因果关系。
环境细节
我使用以下语言版本：R-3.3.1-ATLAS，Stata
v14和Matlab-r2015a，以及软件包v0.15。
有关PHESANT的详细信息，请参见我们的。
该代码使用了一些在Linux环境中需要设置的环境变量。
我设置了一些永久性设置（我在各个项目中使用），并设置了一些临时性设置（仅与该项目相关）。
我使用以下方法临时设置了结果目录和项目数据目录：
export
RES_DIR=
"
${HOME}
/2016-biobank-mr-phewas-bmi/results/sample500k
"
export
PROJECT_DATA=
"
${HOME}
/2016-biobank-mr-phewas-bmi/data/sample500
"
通过将以下内容添加到我的~/.bash_profile文件中，我将IEU共享UKB数据目录和PHESANT代码目录（
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