GPUMD 什么是GPUMD ? GPUMD代表图形处理单元分子动力学。它是在图形处理单元(GPU)上完全实现的通用分子动力学(MD)代码。 通过使用GPU [1],可以大大提高对多体势的力评估[1],这要归功于参考文献中得出的一组简单的力,病毒应力和热流表达式。 [2,3]。 除了高效之外,GPUMD的另一个独特功能是它具有研究热传输的有用工具[2,3,4,5]。 先决条件 您需要具有计算能力不低于3.5的GPU卡以及不低于CUDA 9.0的CUDA工具包。 适用于Linux(带有GCC)和Windows(带有MSVC)操作系统。 编译GPUMD 转到src目录,然后输入make 。编译完成后,将在src目录中生成两个可执行文件gpumd和phonon 。 运行GPUMD 转到目录src 。 键入src/gpumd < examples/input_gpumd.txt来运行exampl
1
在安装amber软件的过程中,所遇到的各种问题,及其最终的解决方法。
2022-05-12 16:58:35 16KB amber 安装
1
低压下微机械谐振器件挤压膜阻尼分子动力学仿真的一种高效算法.doc
2022-05-09 19:14:40 45KB 文档资料 算法
过程建模:实现真空层 输出建模:计算能量,原子坐标 输出控制:格式,参变量 能量最小化方法,计算E0 特殊技巧处理
2022-04-28 16:02:05 2.63MB 分子动力学
1
石墨烯、金属材料模拟、纳米流体、热传导、金属材料摩擦模拟、金属、半导体材料辐照、mofs储氢、碳补集、分子筛纳米膜混合气体分离:膜材料 分子建模、standalone reaxff、蒙特卡洛模拟设置实例:溶液中质子转移、碳化硅表面石墨烯生长 Python、深度学习神经网络、经典机器学习模型、神经网络在催化领域的应用-CO2还原、杂化钙钛矿、有机太阳能电池材料、无机材料、量子点发光材料
1
【lammps】: MD基础视频、lammps安装、进阶:石墨烯、金属材料模拟、 纳米流体专题:KCL盐溶液纳米流动等 热传导模拟专题、多成分体系模拟:金属材料摩擦模拟、材料切削、夹层结构 金属、半导体材料辐照:点缺陷、石墨烯、碳化硅等离位损失 自建分子力场参数和金属有机框架材料晶体模型:mofs储氢、碳补集 分子筛纳米膜混合气体分离:膜材料、SCI文献模拟 【ReaxFF反应力场】 reaxff基础:简单实例操作、结果查看 reaxff计算软件:分子建模、lammps 特殊功能:standalone reaxff、蒙特卡洛模拟设置 实例:溶液中质子转移、碳化硅表面石墨烯生长 【机器学习材料结构和性能预测】 Python、深度学习神经网络、经典机器学习模型、材料数据库及特征工程、图神经网络与实践、机器学习+Science,神经网络在催化领域的应用-CO2还原、预测杂化钙钛矿的带隙和形成能、有机太阳能电池材料的快速筛选、图神经网络预测无机材料的性能、量子点发光材料色温的预测等
2022-04-19 10:05:33 838KB 机器学习 分子动力学 reaxff 材料
1
非晶态Cu80Si20中二十面体短程有序结构的第一性原理分子动力学研究,吴松,M. J. Kramer,本文采用基于密度泛函理论的第一性原理分子动力学模拟方法,研究了液态与非晶态Cu80Si20的短程有序性。通过在1140和300 K温度下的模拟�
2022-04-18 22:26:49 887KB 首发论文
1
Molecular Gas Dynamics入门 详细介绍 Bird-Molecular Gas Dynamics and the Direct simulation of gas flows Yoshio_Sone_Molecular_Gas_Dynamics_Theory, Techniques, and Applications 基本满足分子动力学各阶段学习需求
2022-04-13 17:02:59 28.19MB 分子动力学 MD Bird 动理学
一个强大的应用程序,旨在提供一种手段的看着生物分子系统进行分子分析或类似模拟的任务 分子分析或生物系统的可视化可能听起来很复杂的活动,而事实是,他们实际上是相当复杂的。通常情况下,只有专家和那些研究物理学的人会遇到这些概念的定期进行,但由于与它们关系密切的软件应用程序,几乎所有人都能得到洞察力上什么这是所有关于。
2022-04-10 10:37:34 13.75MB 分子动力学模拟
1
本文件目的是为了应对过慢的下载。侵删 A pair_style quip command which wraps the QUIP libAtoms library, which includes a variety of interatomic poten-tials, including Gaussian Approximation Potential (GAP) models developed by the Cambridge University group.To use this package you must have the QUIP libAtoms library available on your system. Author: Albert Bartok (Cambridge University)
2022-04-09 17:29:35 221.46MB lammps QUIP 分子动力学模拟 自用侵删
1