甲基试剂盒 建置状态 介绍 methylKit是一个软件包,用于DNA甲基化分析和高通量亚硫酸氢盐测序的注释。 该软件包旨在处理及其变体的测序数据,还可以处理靶标捕获方法,例如序列。 此外,methylKit可以处理从Tab-seq或oxBS-seq获得的5hmC的碱基对分辨率数据。 如果提供正确的输入格式,它也可以处理全基因组亚硫酸氢盐测序数据。 当前功能 覆盖率统计 甲基化统计 样本相关和聚类 差异甲基化分析 功能注释和访问器/强制功能 多种可视化选项 区域和平铺窗口分析 (几乎)适当的 直接从对齐文件中读取甲基化调用 批量效果控制 多线程支持(用于更快的差异甲基化计算) 从生物导体包装GenomicRanges对物体施加强制 从通用文本文件中读取甲基化百分比数据 保持最新 您可以订阅我们的googlegroups页面,以获取有关新版本和功能的最新信息(低频率,仅发布更新) 要提问
2024-08-19 13:25:52 687KB visualization methylation statistical-analysis R
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《雷达系统分析与设计使用MATLAB 3rd Edition》是一本深入探讨雷达系统设计与分析的专业书籍,其配套代码提供了实践操作的平台,使理论知识得以直观化和具体化。MATLAB作为强大的数学计算和仿真工具,对于理解和实现雷达系统的各种算法至关重要。 雷达系统的基础在于信号处理,包括信号的生成、发射、接收以及信号处理。MATLAB代码可能涵盖了脉冲压缩、匹配滤波、多普勒处理等关键技术。脉冲压缩技术通过线性调频信号生成宽脉冲,提高距离分辨率;匹配滤波则利用已知信号形状最大化信噪比,提高目标检测性能;多普勒处理则用于分析目标的相对运动,提供速度信息。 雷达目标探测和识别是另一个重点。在MATLAB代码中,可能包含自适应阈值检测、恒虚警率(CFAR)检测等算法。自适应阈值检测根据背景噪声动态设定检测阈值,避免假警报;CFAR技术则确保在不同背景噪声下保持恒定的虚警概率,提高目标检测的可靠性。 再者,雷达系统设计还涉及目标参数估计,如距离、角度和速度的估计。MATLAB代码可能涉及到最小二乘法、最大似然估计等方法,这些方法用于从接收到的回波信号中提取目标参数,提高估计精度。 此外,波形设计也是雷达系统的重要部分。例如,线性调频连续波(LFM)、频率捷变(FM)等雷达波形可能在代码中有所体现,这些波形具有优良的特性,如距离分辨率高、多普勒处理能力强等。 MATLAB代码可能还包括了雷达信号的仿真,模拟真实雷达系统的工作流程,包括发射信号的建模、传播环境的模拟、接收信号的处理等。这有助于读者理解雷达系统在不同条件下的表现,并为优化系统设计提供依据。 在学习这本书时,配合MATLAB代码进行实践,不仅可以加深对理论的理解,还能提高解决实际问题的能力。通过调试代码,可以直观地看到算法的运行效果,这对于理论学习和工程应用都是非常有价值的。因此,这本书的配套代码无疑是学习雷达系统分析与设计的宝贵资源。
2024-08-15 15:46:06 712KB 配套代码
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这份R语言 报告对Forbes自1990年至2020年发布的最富有运动员数据集进行了探索性分析。通过数据预处理、统计摘要和数据可视化,该报告回答了一些研究问题,如全球最高收入运动员和不同国家的运动员收入。在分析过程中,考虑了处理缺失数据、重新编码变量和汇总数据等步骤。此外,报告还进行了相关性分析和假设检验,揭示了变量之间的关系。通过数据汇总和图表,我们了解了运动员收入与排名、年份之间的关系,还通过国家和运动项目分类比较了运动员收入。
2024-07-05 14:09:13 371KB r语言 数据集
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Perl-Critic是一款强大的Perl语言静态代码分析工具,它旨在帮助开发者遵循Perl最佳实践,提高代码质量和可维护性。作为一款可配置且可扩展的工具,Perl-Critic允许用户根据自己的项目需求定制规则集,同时也提供了丰富的内置规则来检查代码中的潜在问题。 Perl-Critic的核心在于其基于Policy的框架。Policy是一系列预定义的编码规范和风格指南,它们涵盖了从基本的语法格式到复杂的编程习惯。例如,有的Policy可能要求所有的函数定义都必须包含文档注释,或者禁止在代码中使用某些被认为是不安全或过时的语言特性。通过启用或禁用不同的Policy,用户可以选择他们想要实施的编码标准。 Perl-Critic的可配置性体现在你可以设置每个Policy的严重级别,从1(最宽松)到5(最严格)。这样,你可以根据团队的需求或项目的复杂性调整检查的严格程度。此外,Perl-Critic还支持自定义Policy,这意味着你可以创建自己的编码规则,以适应特定的项目环境或公司内部的编码规范。 Perl-Critic不仅仅是简单的风格检查器,它还能够检测出潜在的逻辑错误和代码异味。例如,它可能会警告你在代码中使用了未初始化的变量,或者发现有可能导致空指针异常的情况。这些功能对于提升代码的健壮性和可靠性至关重要。 在实际使用中,Perl-Critic可以集成到开发工作流中,比如通过持续集成系统,在代码提交前进行自动化检查。这有助于在早期阶段发现并修复问题,避免了在后期维护中遇到的困难。此外,Perl-Critic的输出报告清晰明了,可以方便地与团队成员共享和讨论,共同提高代码质量。 为了进一步扩展Perl-Critic的功能,开发者可以安装额外的模块,如Perl::Critic::MorePolicies,它提供了更多的Policy选择。同时,Perl-Critic与Perl::Tidy等其他工具结合使用,可以实现更全面的代码格式化和重构。 Perl-Critic是Perl开发者不可或缺的工具,它通过强制执行最佳实践,提高了代码的可读性、可维护性和一致性。通过深入理解和合理运用Perl-Critic,开发者可以编写出更加专业、高质量的Perl代码。
2024-07-04 17:54:47 1022KB static-code-analysis perl static-analysis
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基于R语言开发时间序列预测 Time Series Analysis With Applications in R 学习笔记 基于R语言开发时间序列预测 Time Series Analysis With Applications in R 学习笔记 基于R语言开发时间序列预测 Time Series Analysis With Applications in R 学习笔记 基于R语言开发时间序列预测 Time Series Analysis With Applications in R 学习笔记 基于R语言开发时间序列预测 Time Series Analysis With Applications in R 学习笔记 基于R语言开发时间序列预测 Time Series Analysis With Applications in R 学习笔记 基于R语言开发时间序列预测 Time Series Analysis With Applications in R 学习笔记 基于R语言开发时间序列预测 Time Series Analysis With Applications in R 学
2024-07-04 12:40:54 5.98MB r语言 时间序列
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Stock_Market_Sentiment_Analysis-master.
2024-06-18 21:15:11 27.64MB
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Learn DAX Overview Videos DAX functions DAX function reference overview New DAX functions Date and time functions Date and time functions overview
2024-06-16 16:52:57 2.45MB Power
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情感分析 一个基本的情绪分析器会从twitterAPI中获取推文,并对其进行分析,并显示有多少推文支持该推文,而有多少则不支持该特定关键字。一次分析10条推文。 Textblob库用于分析目的。 复制您的不记名令牌。 打开终端,然后键入以下命令。 export BEARER_TOKEN = {您的BEARER TOKEN}
2024-06-04 12:34:14 2KB Python
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This book provides an introduction to the use of geometric partial differential equations in image processing and computer vision. It brings a number of new concepts into the field, providing a very fundamental and formal approach to image processing. State-of-the-art practical results in a large number of real problems are achieved with the techniques described. Applications covered include image segmentation, shape analysis, image enhancement, and tracking. The volume provides information for people investigating new solutions to image processing problems as well as for people searching for existent advanced solutions.
2024-05-04 16:45:59 10.84MB Image Analysis
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MSMBuilder的 MSMBuilder是一个python软件包,它为高维时间序列实现了一系列统计模型。 它特别专注于生物分子动力学的原子模拟的分析。 例如,MSMBuilder已用于通过分子动力学(MD)模拟对蛋白质折叠和构象变化进行建模。 LGPL(v2.1或更高版本)提供MSMBuilder。 功能包括: 将特征提取到二面体,联系方式等中 具有多种算法的几何聚类。 使用时间结构独立成分分析(tICA)和主成分分析(PCA)进行降维。 马尔可夫状态模型(MSM)的构造 率矩阵MSM构造 隐藏马尔可夫模型(HMM)构造 时标和过渡路径分析。 在查看文档,并加入。 有关MSMBuilder的更广泛概述,请看一下我们的。 安装 对于优选的安装机构msmbuilder与conda : $ conda install -c omnia msmbuilder 如果您没有cond
2024-04-30 19:04:32 2.28MB python analysis clustering
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