COVID19-mesa
Santiago Nunez-Corrales，UIUC的信息学和NCSA（ ）
埃里克·（Eric Jakobsson），UIUC分子与细胞生物学和NCSA（ ）
一个简单的模拟，可通过基于代理的建模（ABM）探索COVID-19的传染性，以及各种措施的潜在有效性。
该软件正在快速开发中，以尝试对当前情况做出响应，应牢记这一点。 特定社区的任何情景都应始终视为临时情景，并根据最新和最佳策划的现场证据不断进行修订。
参考出版物：
Núñez-Corrales，S.和Jakobsson，E.（2020）。 流行病学工作台：社区应对COVID-19和其他传染病的策略工具。 。
安装（Linux和朋友）
克隆存储库：
git clone https://github.com/snunezcr/COVID19-mesa.git
创建并激活虚拟环境
2021-09-25 21:58:00
76.73MB
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ClinicalTrials.gov是一个在全球范围内进行的私人和公共资助的临床研究的数据库。它由国立卫生研究院维护。所有数据都是公开可用的，并且该站点提供直接下载功能，这使使用相关数据进行分析变得非常容易。该数据集由与现场展示的COVID 19研究相关的临床试验组成。
COVID clinical trials.csv
COVID-19 Clinical Trials dataset_COVID-19 CLinical trials studies_datasets.zip
2021-09-24 10:40:06
22.55MB
1
CovBit：一个完整的应用程序，用于更新COVID-19新闻，进行自我评估，获取附近人员的通知以保持社交距离并跟踪COVID-19积极用户的位置
2021-09-07 14:52:11
2.33MB
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基于 ML 的 COVID-19 下社交媒体用户注意力分析。|| 基于机器学习的COVID-19疫情背景下，分阶段的微博数据文本情感分析，先爬取，再用消息、情感词典和多维情感分析，并可视化
2021-09-07 13:03:45
44.84MB
Covid-19-肺段
从一对肺的CT扫描中分割毛玻璃不透明（瘢痕组织）的算法。 该算法能够确定肺部损伤的严重程度，并能够预测患者是否患有COVID-19以及达到何种程度。
2021-09-03 20:16:50
1.98MB
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冠状动脉CT
该数据集的实用性已由中国武汉同济医院的一名高级放射科医生确认，他在1月至4月的疾病暴发期间对大量COVID-19患者进行了诊断和治疗。
发布此数据集后，我们收到了一些反馈，表达了对该数据集可用性的担忧。 主要问题概述如下。 首先，将原始CT图像放入纸张中后，这些图像的质量会下降，这可能会使诊断决策的准确性降低。 质量下降包括：损失了Hounsfield单位（HU）值； 每个像素的位数减少； 图像的分辨率降低。 其次，原始的CT扫描包含一系列CT切片，但是当放入论文中时，只选择了几个关键切片，这也可能对诊断产生负面影响。
我们就这两个问题咨询了同济医院的放射科医生。 放射科医生认为，这些问题引起的问题不会显着影响诊断决策的准确性。 首先，经验丰富的放射科医生能够根据低质量的CT图像做出准确的诊断。 例如，给定由智能手机拍摄的原始CT图像照片，尽管照片中的CT图像质量比原始CT图像低得多，但是有经验的放射科医生仅通过查看照片即可做出准确的诊断。 同样，论文中的CT图像与原始CT图像之间的质量差距不会在很大程度上损害诊断的准确性。 其次，虽然最好读取一系列CT切片，但通常单
2021-08-31 13:40:54
370.82MB
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佐纳·罗莎（ZonaRossa）
ABM模拟Covid-19的扩散和政府对红色或白色区域的建立的React
2021-08-27 14:17:20
5KB
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超级市场中基于代理的COVID-19传输模型。
该代码与。
安装
我们的软件包主要依赖 ，它需要Python> = 3.6。
> pip install covid19-supermarket-abm
例子
在下面的示例中，我们使用包中包含的示例数据，在给定以下参数的情况下，模拟了虚拟商店中的一天。
from covid19_supermarket_abm . utils . load_example_data import load_example_store_graph , load_example_paths
from covid19_supermarket_abm . path_generators import get_path_generator
from covid19_supermarket_abm . simulator import simulate_one_day
2021-08-27 14:00:32
81KB
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COVID-19衍生的资料集（JHU，NY Times，ECDC）
目录：
，
数据集： ， ， ，
，
关于
该存储库包含与COVID-19相关的各种数据集（JHU CSSE，NY Times，ECDC）：
数据文件位于文件夹中；
原始数据和中间数据文件可在文件夹中找到；
此外，还可以在以下位置获得一些基于派生数据集的可视化效果：
或在此存储库的文件夹内；
这些数据集都不是我收集的，但是我已经对其进行了重新处理，重新格式化和扩充，以便于操作。
使用者
（论文） ；
（网站） ；
（网站） ;
（代码） ;
（代码） ;
（代码） ;
（代码） ;
免责声明
就像现在互联网上的任何东西一样，我对任何事情都不承担任何责任。 :)
可视化
我已根据JHU CSSE数据集创建了6个国家/地区组，并为每个组绘制了所有可用指标：
global 或确认病例超过5万的全球国家；
global-major - 或 -世界各地的国家拥有超过40万确诊病例;
global-medium 或确诊病例超过10万但少于40万的全球国家/地区；
global-m
2021-08-24 22:34:05
910.84MB
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