该数据集包含对糖尿病性黄斑水肿的光学相干断层扫描图像进行分割的图像。数据集载自文章：S. J. Chiu, M. J. Allingham, P. S. Mettu, S. W. Cousins, J. A. Izatt, S. Farsiu, "Kernel regression based segmentation of optical coherence tomography images with diabetic macular edema", ( BIOMEDICAL OPTICS EXPRESS), 6(4), pp. 1172-1194, April, 2015
Segmentation of OCT images (DME)_datasets.txt
2021-10-07 18:15:30
342B
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OCT文件转换器
该存储库包含用于从制造商的专有文件格式中提取原始光学相干断层扫描（OCT）和眼底数据的代码。
动机
制造商使用专有数据格式存储数据通常会阻碍眼科研究。 例如，直到最近，UK Biobank项目中约200,000次OCT扫描仅以Topcon的.fds文件格式提供，这阻止了批量处理和分析。 唯一允许访问这些扫描的免费软件是 ，它是用C ++编写的，不再进行维护。 该存储库旨在提供可用的基于python的工具来读取这些专有格式。
支持的文件格式
.fds（Topcon）
.fda（Topcon）
.e2e（海德堡）
.img（Zeiss）
.dcm
安装
需要python 3.7或更高版本。
pip install oct-converter
用法
examples /中包含许多示例用法脚本。
这是读取.fds文件的示例：
from oct_converter .
2021-09-27 10:31:57
17KB
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Qualcomm-Cellular-V2X-AESIN-Oct-2016.pdf
2021-09-18 15:01:27
2.53MB
Press.IBM.Cognos.10.Report.Studio.Oct.2011
2021-08-22 11:09:31
13.81MB
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OCT原理类与超声成像想死，不同点是光波替代了超声波。OCT使用测量光脉冲在样品内部被散射和传播延时，通过处理，形成高分辨率、深度的图像来分析活体内在的微观结构，无须物理接触。横向扫描可以快速获取非侵入性二维的和三维的清晰图像。由于光波波长很短，因而分辨率很高，OCT成像的分辨率是微米量级，而超声成像最好的分辨率是100微米级。但是由于光速远快于声速，接近于声速的100万倍，使得时间延时短至10-15秒，电子设备难以直接测量，这种差异造成了测量结构和距离的不同，因此，OCT只能利用光学干涉仪装置进行测量。OSE-2000内部有一台干涉仪，超快激光或低相干光源光束，经过透反分束镜，分为一束参考光和一束信号测量光。
2021-08-09 16:21:13
53KB
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