分子动力学一一一从算法到应用 ,Understanding Molecular Simulation -From Algorithms to Applications,分子动力学模拟中文版。
2021-08-26 11:16:37 59.41MB 分子动力学
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matlab初学代码简单md-matlab 具有Lennard-Jones(LJ)势的分子动力学(MD)模拟的100行MATLAB实现。 特征 这是一个很小但有效的MD代码,对初学者特别有用。 它包含力评估功能的两个版本:“ find_force”和“ find_force_vectorized”。 在后者中,一个原子与其相邻原子之间的对力计算被矢量化。 事实证明,矢量化版本的速度约为普通版本的3倍。 文件组织 有两个脚本: test_md.m test_md_vectorized.m “ test_md.m”脚本在“ md.m”文件中调用“ md”功能。 “ test_md_vectorized.m”脚本在“ md_vectorized.m”文件中调用“ md_vectorized”功能。 “ md”函数调用以下文件中的函数: initialize_position.m initialize_velocity.m find_neighbor.m find_force.m “ md_vectorized”函数调用以下文件中的函数: initialize_position.m initi
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