igvScreenshot:使用 IGV 创建基因组区域的静态屏幕截图

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igv截图使用 IGV 创建基因组区域的静态屏幕截图。＃＃精简版为每个样本创建一个目录，其中包含一个 IGV XML 文件和您希望查看的基因组站点的床文件。从该目录，使用 bash igvCreateBatchFiles.sh 创建批处理文件然后，要为 LSF 集群上的每个示例创建屏幕截图，请运行 for i in *.igv;do bsub -oo err.log -q long -M 12000000 -R 'select[mem>12000] rusage[mem=12000]' "bash ~cmiller/oneoffs/igvCreateSnapshots.sh $i"; done 您的屏幕截图将存储在 SAMPLENAME_snaps 中，看起来类似于下面附加的缩略图。我喜欢 geeqie 程序可以快速浏览它们。您可以使用“sudo apt-g

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