USEARCH_工作流 我用来通过 UPARSE 和 QIIME 处理原始 Illumina 扩增子测序数据的 shell 脚本。 这对我来说更像是一种在分析之间保持工作流程一致的方式 - 如果您发现这一点,我目前无法提供任何支持。 注意:该脚本在 2015 年 2 月 25 日发布静态版本,用于即将发布的版本。
2021-12-28 13:07:11 15KB Shell
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1、整理的关于微生物扩增子方面的数据库,包括常用的Silva、GreenGene、RDP以及ITS库UNITE; 2、抗体、病原体相关数据库。
2021-05-08 15:02:49 184KB 生物信息学 微生物、 扩增子
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便于查阅的QIIME2扩增子分析流程及常用命令(我的博文https://blog.csdn.net/weixin_42126262/article/details/107285753) pdf 版,包含QIIME2的16S扩增子分析流程基础内容、常用命令、部分图文解释。
2021-03-23 16:45:22 1.09MB 生物信息 16S扩增子 生信分析工具
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