针对水下模拟船舱相关参数的高速多次采集存储任务，设计了一种基于eMMC的多通道数据采集系统。该系统以FPGA为主控芯片，控制8个通道模拟多路复用开关和8个AD转换器来实现128路信号同时采集。与传统采集系统相比，该系统以eMMC为存储单元，解决了传统的以Flash为存储模块的复杂的坏块检测与系统管理等问题。试验证明，128路数据采集存储系统的误差可控制在0.1%范围内，能够确保已存的数据可靠、有效。