利用生物质谱仪器进行蛋白鉴定和定量分析时,往往要获得一个蛋白的理论酶切肽段,该程序提供了一个对蛋白进行胰酶切的程序,规则(R、K切,RP、KP不切)。程序需要输入一个FASTA格式的蛋白序列文件(压缩包中是文件InternalStandards.fasta),输出文件可以自己设定,必须保证有输入和输出文件,程序才能运行。另外,程序还提供漏切次数和肽段长度选项
2022-06-13 10:16:22 3.55MB FASTA格式 、理论酶切(K.R)
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gb2fasta:Perl脚本,用于将GenBank记录转换为FASTA格式
2022-05-09 14:44:18 14KB perl genbank fasta PerlPerl
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FASTA格式序列特征提取方法,初砚硕,王清丽,在生物信息学中,FASTA格式是存储核酸序列或氨基酸序列的常用文本格式,每一个氨基酸或核酸用某个固定字母来表示。DIP数据库、NCBI数
2021-11-25 10:02:43 365KB 首发论文
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cbbl 从NCBI核苷酸数据库下载所有cbbl基因的脚本,并以fasta格式输出。 只需更改搜索词和输出即可将其通用化。
2021-11-10 19:57:21 300KB Python
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使用Python分析Multi-Fasta格式的DNA序列 一个Python程序,将包含多FASTA格式的DNA序列的文件作为输入,并计算以下问题的答案: 文件中有几条记录? FASTA文件中的记录定义为单行标题,后跟序列数据行。 在第一列中,标题行与序列数据之间用大于号(“>”)隔开。 “>”符号后的单词是序列的标识符,该行的其余部分是该条目的可选描述。 “>”和标识符的首字母之间不应有空格。 文件中序列的长度是多少? 最长的序列是什么,最短的序列是什么? 是否有一个以上的最长或最短序列? 它们的标识符是什么? FASTA格式 FASTA格式的序列文件可以包含多个序列。 FASTA格式的每个序列均以单行描述开头,后跟序列数据行。 广告内容描述行必须在第一列中以大于(“>”)符号开头。 FASTA格式的示例序列为: AB000263 | ACC = AB000263 | DESCR
2021-11-08 10:49:48 14KB Python
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以前导入数据时都是一行行的导入,有时需要根据数据指定特定的分隔符,比如以>开头的fasta数据,在处理过程中顺便把多行的碱基序列变成了一行,自己摸索的写出来的
2021-06-15 17:08:34 279B Python fasta 分隔符
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来自维基百科中文版本的FASTA文件格式介绍。由于维基百科被和谐了,特在此分享。
2021-03-27 20:08:07 1.32MB fasta 基因测序 生物信息学 生物学
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氨基酸符号序列转换为FASTA格式的蛋白质序列,直接编译,将英文氨基酸序列粘贴到窗口,按回车即可输出转换结果。
2019-12-21 19:38:25 2KB FASTA 生物信息 蛋白质序列
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