内容概要:本文档是生信帮提供的Hi-C互作分析培训资料,详细介绍了Hi-C数据分析的全流程,包括质控、AB鉴定、TAD鉴定和Loop鉴定。Hi-C质控部分主要描述了HiC-Pro工具的使用,涵盖从测序数据(FASTQ文件)到交互矩阵的生成过程,包括两步对齐策略、数据过滤和有效对保存。AB鉴定部分介绍了通过计算Hi-C矩阵的PCA特征向量来识别A/B区室的方法。TAD鉴定部分描述了使用TAD-separation score度量来确定TAD边界,并生成多个输出文件以供后续分析。Loop鉴定部分则介绍了如何将原始矩阵转换为校正矩阵,并使用hicDetectLoops工具进行loop检测。 适合人群:具备生物信息学基础知识,特别是对基因组三维结构研究感兴趣的科研人员和研究生。 使用场景及目标:①掌握Hi-C数据分析的基本流程,包括数据预处理、质控和下游分析;②学会使用HiC-Pro、hicPCA、hicFindTADs和hicDetectLoops等工具进行具体操作;③理解Hi-C数据分析中的关键概念和技术细节,如有效对筛选、PCA特征向量计算、TAD分离得分和loop检测。 阅读建议:此资源详细介绍了Hi-C数据分析的具体步骤和工具使用方法,建议读者在学习过程中结合实际数据进行练习,并仔细阅读每个工具的参数说明,确保理解各个步骤的意义和作用。同时,建议读者关注数据质量控制,合理设置参数以提高分析结果的可靠性。
2026-04-03 16:53:47 410KB Bioinformatics 基因组学 数据处理流程
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简单介绍Pleiades和Pleiades的处理流程,数据组织结构,文件命名,定位精度等。
2023-07-17 13:41:41 8.52MB Pleiades
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数据处理流程的主要环节6页.pdf
2022-06-01 10:01:04 473KB 资料
报告人:杨见兵 北斗数据处理流程与结果 基于GAMIT10.61版本
2022-04-12 16:15:08 7.38MB Gamit 北斗 复合星历
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通过对徕卡LGO静态数据处理流程,可以充分了解lgo软件静态数据处理过程
2022-03-15 13:32:20 5.12MB 徕卡LGO
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随着北斗系统的卫星的不断增多,北斗数据质量有了显著的提升。北斗数据的高精度处理也成了一项必备的技能。本文是基于gamit10.6的北斗数据处理教程。包含北斗数据下载及处理命令介绍以及结果分析。
2022-02-20 13:02:53 8.36MB GAMIT  GSNN 北斗数据处理
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个人收集的遥感数据处理流程资料,相关学习人士可以下来看看
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介绍使用Gamit解算北斗卫星数据的教程。里面有复合GNSS星历、复合GNSS原始数据的下载地址。资源为PPT文档。
2021-09-28 18:05:22 7.38MB Gamit 北斗 复合星历
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文件中包含原始激光雷达数据,MATLAB读取.ubh文件、点云数据滤波、误差分析、模型验证、三维表面拟合的源代码,目前调试无误
高分一号卫星是中国高分辨率对地观测系统的第一颗卫星,由中国航天科技集团公司所属空间技术研究院研制。于2013年4月26日12时13分04秒由长征二号丁运载火箭成功发射,开启了中国对地观测的新时代。高分一号卫星是中国高分辨率对地观测系统的首发星,搭载了两台2m分辨率全色/8m分辨率多光谱相机,四台16m分辨率多光谱相机。突破了高空间分辨率、多光谱与宽覆盖相结合的光学遥感等关键技术,设计寿命5至8年。 高分一号卫星发射成功后,将能够为国土资源部门、农业部门、环境保护部门提供高精度、宽范围的空间观测服务,在地理测绘、海洋和气候气象观测、水利和林业资源监测、城市和交通精细化管理,疫情评估与公共卫生应急、地球系统科学研究等领域发挥重要作用。
2021-09-01 21:14:40 367KB GF
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