DoMultiBarHeatmap 为Seurat对象创建多栏注释的热图 改编自Seurat，由Arjun Arkal Rao在撰写的工作改编而成。 安装 需要R包： ggplot 朗朗 苏拉特 磁珠 使用devtools安装 devtools::install_github("elliefewings/DoMultiBarHeatmap") 或从父目录下载并安装 devtools::install("DoMultiBarHeatmap") #Load library library(DoMultiBarHeatmap) 用法 data("pbmc_small" DoMultiBarHeatmap(object = pbmc_small, group.by="cluster", additional.group.by="cell_type") 争论 争论 定义 目的 修罗对象 特征

苏拉特对RNA的速度 罗勒·库德（Basil Khuder） 介绍 本指南将演示如何结合RNA Velocity分析使用已处理/标准化的Seurat对象。 请记住，尽管Seurat是基于R的，但是所有可用的RNA Velocity软件/软件包都是Python，因此我们将在两者之间来回移动。 我们将使用以下程序： scVelo （用于RNA速度） Velocyto或Kallisto Bustools （产生我们最初的RNA Velocity Object） Anndata （用于操纵我们的RNA Velocity对象） 苏拉特 Samtools-可选（Velocyto将在未排序的.bam上运行Samtools排序） 生成Loom文件 首先，我们将为您在Seurat分析中使用的每个单细胞样本生成织机文件（一种为基因组数据集（例如单细胞）设计的文件格式）。 织机文件不同于您在Seura