igv截图
使用 IGV 创建基因组区域的静态屏幕截图。
＃＃精简版
为每个样本创建一个目录，其中包含一个 IGV XML 文件和您希望查看的基因组站点的床文件。
从该目录，使用 bash igvCreateBatchFiles.sh 创建批处理文件
然后，要为 LSF 集群上的每个示例创建屏幕截图，请运行
for i in *.igv;do
bsub -oo err.log -q long -M 12000000 -R 'select[mem>12000] rusage[mem=12000]' "bash ~cmiller/oneoffs/igvCreateSnapshots.sh $i";
done
您的屏幕截图将存储在 SAMPLENAME_snaps 中，看起来类似于下面附加的缩略图。 我喜欢 geeqie 程序可以快速浏览它们。 您可以使用“sudo apt-g
2022-09-08 21:47:28
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igv.js
igv.js是由团队开发的可嵌入交互式基因组可视化组件。
以下是示例和快速入门指南。 有关更多文档，请参见 。
例子
快速开始
安装
igv.js由一个没有外部依赖性的javascript文件组成。 要直接链接到当前版本，请复制此代码段
< script src =" https://cdn.jsdelivr.net/npm/igv@2.7.9/dist/igv.min.js " > </ script >
可以从https://cdn.jsdelivr.net/npm/igv@2.7.9/dist/下载ES5（igv.min.js）和ES6（igv.esm.min.js）的预构建文件。
或者，您可以使用npm安装
npm install igv
并在node_modules / igv / dist中为您的模块系统（igv.min.js或igv.esm.min.
2021-08-18 18:34:03
8.19MB
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